当时57岁的他辞去北京出版集团的职务再次回到了曾工作16年的西藏，“当时没有资金，车也是自己的，也不知道要建在哪。后来，多方努力，得到了北京和拉萨两地的支持，博物馆纳入了北京重点援藏项目。”
西藏牦牛博物馆建成后，牦牛文化走到了更远的地方，曾到北京、广州、南京、杭州等很多城市展览。牦牛粪作为镇馆之宝，是每次展出的必备。他说：“很多人以为牦牛粪很臭，闻后都说有股牧草的清香。在外展出，馆员们学会了不少牧民技能，都会砌牛粪墙，做灶。”
由此，吴雨初建团队，开始了3年的筹备工作。行走3万公里，他和团队进行田野调查和藏品收集，困难重重，又一次次被牧民们的热心感动。牧区没有博物馆概念，藏语中也没有博物馆的直译。吴雨初向牧民做了最简单的解释：要给“亚”(藏语，意为牦牛)建“颇章”(藏语，意为宫殿)。申扎县的一位牧民听说北京的汉族人到西藏给牦牛建宫殿，特别感动。他们一家人做了一顶牦牛帐篷，坐了3天的汽车送到了拉萨。
吴雨初介绍：“牦牛头骨均是它生前主人送来，博物馆给这些牦牛头骨做了编码，编码背后记录了它主人的名字、它的名字和性别，家住哪里、海拔多高、一生产了多少奶、多少酥油。你看上面那一层个头小的全是母牦牛的。”
梁朝伟经典电影5月18日是国际博物馆日，这一天，西藏牦牛博物馆刚好走过十年，这是中国唯一一座牦牛主题博物馆。牦牛粪是镇馆之宝，一半藏品由牧民们无偿捐赠，凭借这些，这座博物馆一次次“出圈”，成为西藏热门旅游打卡地。
西藏牦牛博物馆共4个展厅，藏品诠释着高原大地历史文化、畜牧文化、器物文化、生态文化，以及音乐、舞蹈等艺术文化。感恩展厅内，墙上悬挂了152头牦牛头骨，甚为壮观。
过去十年，西藏牦牛博物馆接待过不少国外政要、科学家、博物学家等。其中，有位美国考古学家，机缘巧合之下，他在这里竟见到了已故父亲的照片以及研究牦牛的论文，这一跨越重洋的不期而遇让他感动不已，潸然泪下。
为何选择牦牛作为表达西藏文化的符号？吴雨初解释：“一说到西藏文化，很多人便认为就是宗教文化，我不这么看，牦牛文化比宗教文化早得多，它由高原劳动人民创造而来，它才是真正的高原象征。”
他还说，牦牛身上的肉、血、奶、皮、毛、骨、粪便等等一切，成就了西藏高原人的衣、食、住、行、运、烧、耕，所以当之无愧。
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